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Communication and identification of DNA based fungal species
TH000592: Agaricaceae | SH175447.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH175447.07FU | New version of this SH is available: SH1503601.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 11

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales

Representative sequence: EF527341
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

Distribution of distances 
SH graph
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SH code (Count*/Total count**)
SH1503601.08FU (11/11);
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SH code (Count*/Total count**)
SH239246.06FU (11/11);
*Number of sequences carried over from previous version
**Total number of sequences composing this SH in current version
Distribution map
*Locations without exact coordinates are displayed as spherical country centroids
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Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
EF527288AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. BR007)Brazil              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------gtaggtgaacctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taaa----ctgccttga--tgggt--tgtc-gctgg-cc--tctt---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacttattgtag---ttcta--tac----tct-ct---gaaggctg-agaa-agc-------agg--------tctgt--tgt--tcag-ttgag---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-c---------cctaa---------agc-----tttcctc------tgtt-ggtcttgtgga--------------at---catacctctttga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-cat-tgt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatt-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg-c--tttttgttggct----ggt--tggg-gcttgg-at-g-tggaggtg----ttgtcgg-cc--tttat-------a-ggttggctcctctgaaatgca-ttagtggaa-ccgtttgcgatccgtca-c--gggt-gtgat-aatt-atctacgcccagt-ggg-ttgctctct-gtcttgttcagc-tgcc-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aac-c--agt-tactgaatatt-tgacctcaaatcaggtag---------------
EF527280AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. ASM1)France              ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taaa----ctgccttga--tgggt--tgtc-gctgg-cc--tctt---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacttattgtag---ttcta--tac----tct-ct---gaaggctg-agaa-agc-------agg--------tctgt--tgt--tcag-ttgag---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-c---------cctaa---------agc-----tttcctc------tgtt-ggtcttgtgga--------------at---catacctctttga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-cat-tgt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatt-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg-c--tttttgttggct----ggt--tggg-gcttgg-at-g-tggaggtg----ttgtcgg-cc--tttat-------a-ggttggctcctctgaaatgca-ttagcggaa-cngtttgcgatccgtca-c--gggt-gtgat-aatt-atctangcccagt-ggg-ttgctctct-gtcttgttcagc-tgcc-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aac-c--agt-tactgaatatt-tgacctcaaatcag-------------------
EF527394(7)AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. PA676)Panama              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------gtaggtgaacctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taaa----ctgccttga--tgggt--tgtc-gctgg-cc--tctt---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacttattgtag---ttcta--tac----tct-ct---gaaggctg-agaa-agc-------agg--------tctgt--tgt--tcag-ttgag---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-c---------cctaa---------agc-----tttcctc------tgtt-ggtcttgtgga--------------at---catacctctttga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-cat-tgt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatt-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg-c--tttttgttggct----ggt--tggg-gcttgg-at-g-tggaggtg----ttgtcgg-cc--tttat-------a-ggttggctcctctgaaatgca-ttagcggaa-ccgtttgtgatccgtca-c--gggt-gtgat-aatt-atctacgcccagt-ggg-ttgctctct-gtcttgttcagc-tgcc-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aac-t--agt-tactgaata------------------------------------
EF527281AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. ASM2)France              ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------ctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taaa----ctgccttga--tgggt--tgtc-gctgg-cc--tctt---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacttattgtag---ttcta--tac----tct-ct---gaaggctg-agaa-agc-------agg--------tctgt--tgt--tcag-ttgag---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-c---------cctaa---------agc-----tttcctc------tgtt-ggtcttgtgga--------------at---catacctctttga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tatagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-cat-tgt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaangcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatt-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg-c--tttttgttggct----ggt--tggg-gcttgg-at-g-tggaggtg----ttgtcgg-cc--tttat-------a-ggttggctcctctgaaatgca-ttagcggaa-ccgtttgcgatccgtca-c--gggt-gtgat-aatt-atctatgcccagt-ggg-ttgctctct-gtcttgttcagc-tgcc-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aac-c--agt-tactgaatatt-tgacctcaaatcaggtag---------------
** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)