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Communication and identification of DNA based fungal species
TH000592: Agaricaceae | SH175451.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH175451.07FU | New version of this SH is available: SH1503598.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 7

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales

Representative sequence: EF527350
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

Distribution of distances 
SH graph
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SH code (Count*/Total count**)
SH1503598.08FU (7/7);
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SH code (Count*/Total count**)
SH239633.06FU (7/7);
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**Total number of sequences composing this SH in current version
Distribution map
*Locations without exact coordinates are displayed as spherical country centroids
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Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
EF527387AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. PA665)Panama              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------gtaggtgaacctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taa--------ccttga--tgggt--tgtt-gctgg-cc--tctc---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacctattgtag---ttctg--tac----tca-ct---gggggtca-agaa-agc-------ngg---------ctat--tgt--tcag-ttgaa---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-t---------attct---------ggc-----tttcttc------tgct-agctttgtgga--------------at---tgtacttcctcga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-ctt-agt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatc-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg----cttttgttagct----ggc--tgga-gcttgg-ac-a-tggaggtg----ttgcagg-cc--tttat-------a-ggtcagctcctctgaaatgca-ttagcggaa-ccgtttgcgatccgtca-c--aggt-gtgat-aatt-atctaca-ccagt-ggg-ttgctctct-gtnttgttcagc-tgcc-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aat-c--att-tactgaata------------------------------------
EF527358AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. PA624)Panama              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------gtaggtgaacctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taa--------ccttga--tgggt--tgtt-gctgg-cc--tctc---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tnac-t--ct-attcatccacctgtg-cacctattgtag---ttctg--tac----tca-ct---gggggtca-agaa-agc-------ggg---------ctat--tgt--tcag-ttgaa---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-t---------attct---------ggc-----tttcttc------tgct-agctttgtgga--------------at---tgtacttcctcga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-ctt-agt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatc-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg----cttttgttagct----ggc--tgga-gcttgg-ac-a-tggaggtg----ttgcagg-cc--tttat-------a-ggtcagctcctctgaaatgca-ttagcggaa-ccgtttgcgatccgtca-c--aggt-gtgat-aatt-atctaca-ccagt-ggg-ttgctctct-gttttgttcagc-tgcc-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aat-c--att-tactgaata------------------------------------
EF527353AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. PA618)Panama              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------gtaggtgaacctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taa--------ccttga--tgggt--tgtt-gctgg-cc--tctc---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacctattgtag---ttctg--tac----tca-ct---gggggtca-agaa-agc-------agg---------ctat--tgt--tcag-ttgaa---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-t---------attct---------ggc-----tttcttc------tgct-agctttgtgga--------------at---tgtacttcctcga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-ctt-agt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatc-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg----cttttgttagct----ggc--tgga-gcttgg-ac-a-tggaggtg----ttgcagg-cc--tttat-------a-ggtcagctcctctgaaatgca-ttagcggaa-ccgtttgcgatccgtca-c--aggt-gtgat-aatt-atctaca-ccagt-ggg-ttgctctct-gtnttgttcagc-tgcn-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aat-c--att-tactgaata------------------------------------
EF527352(1)AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. PA617)Panama              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------gtaggtgaacctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taa--------ccttga--tgggt--tgtt-gctgg-cc--tctc---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacctattgtag---ttctg--tac----tca-ct---gggggtca-agaa-agc-------ggg---------ctat--tgt--tcag-ttgaa---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-t---------attct---------ggc-----tttcttc------tgct-agctttgtgga--------------at---tgtacttcctcga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-ctt-agt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatc-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg----cttttgttagct----ggc--tgga-gcttgg-ac-a-tggaggtg----ttgcagg-cc--tttat-------a-ggtcagctcctctgaaatgca-ttagcggaa-ccgtttgcgatccgtca-c--aggt-gtgat-aatt-atctaca-ccagt-ggg-ttgctctct-gttttgttcagc-tgcc-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aat-c--att-tactgaata------------------------------------
EF527349AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. PA614)Panama              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------gtaggtgaacctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taa--------cgttga--tgggt--tgtt-gctgg-cc--tctc---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacctattgtag---ttctg--tac----tca-ct---gggggtca-agaa-agc-------ggg---------ctat--tgt--tcag-ttgaa---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-t---------attct---------ggc-----tttcttc------tgct-agctttgtgga--------------at---tgtacttcctcga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-ctt-agt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatc-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg----cttttgttagct----ggc--tgga-gcttgg-ac-a-tggaggtg----ttgcagg-cc--tttat-------a-ggtcagctcctctgaaatgca-ttagcggaa-ccgtttgcgatccgtca-c--aggt-gtgat-aatt-atctaca-ccagt-ggg-ttgctctct-gttttgttcagc-tgcc-aa-ct-gt---ccga-------aa-ggac--aat-c--att-tactgaata------------------------------------
EF527362AgaricaceaeAgaricaceae (Lepiotaceae sp. PA630A...Panama              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------gtaggtgaacctgc-ggaa-ggatcattattgaa-taa--------ccttga--tgggt--tgtt-gctgg-cc--tctc---ga-ggca-tgtgcac-gcctgtct-tgac-t--ct-attcatccacctgtg-cacctattgtag---ttctg--tac----tca-ct---gggggtca-agaa-agc-------ngg---------ctat--tgt--tcag-ttgaa---aca-c-actg-------ga----t-ttgaggattgc-t---------attct---------ggc-----tttcttc------tgct-agctttgtgga--------------at---tgtanttcctcga---g-----------gatagggctatgtc-t-tttatc-ataaacca-tgtagtatgttgccagaatgt-attc-aat-gggc-ctt-agt--gcctat--aa-aaccttatacaactttcagcaacggatctcttggctctcgcatcgatgaagaacgcagcgaaatgcgataagtaatg-tgaattgcagaattcagtgaa-tcatcgaa-tctttgaacgcaccttgcgct-ccttggtattccgaggagcatgcctgtttgagtgtcagtaatc-tctcaa--ct-c--ctc---t--gg----cttttgttagct----ggc--tgga-gcttgg-an-a-tggaggtg----ttgcagg-cc--tttat-------a-ggtcagctcctctgaaatgca-ttagcggaa-ccgtttgcgatccgtca-c--aggt-gtgat-aatt-atctaca-ccagt-ggg-ttgctctct-gtnttgttcagc-tgcn-aa-ct-gt---cnga-------aa-ggac--aat-c--att-tactgaata------------------------------------
** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)