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Communication and identification of DNA based fungal species
TH003938: Amanita breckonii Thiers & Ammirati | SH179058.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH179058.07FU | New version of this SH is available: SH1553696.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 3

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales; Amanitaceae; Amanita
Index Fungorum: urn:lsid:indexfungorum.org:names:109588

Representative sequence: KR919758
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

Distribution of distances 
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Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
KJ535439Amanita breckoniiAmanita breckonii (Amanita breckoni...United States              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGAA------------------------------------------------------------AT---AA--A-ACT-----C-G-GGC-A----A--GGGGG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGGTGGTTGT-----AGCTGG--CCCCT---T--A-GGGGC-ATGTGC-ACAC----TG----TC--TCTC--TCTC-TTGCTTG--------------TTTTTTTAAAATTCTTTCCACTT-GTGCACTG-CTTGT-AGGC-AGG-------CC--TG------G-------CATT-G--TTCA-----GG-TTGTCTATG-A-TTTTC-TTT--AC--ATAC----ACG---A---ATCA--TTGTTGTAC--AGAATG-TGAT-AATAAT----AAA-AAAAG--------------------------------AGTAATACAACTTTCAACAA-CGGA-TCTC-TTGGCTCTCGC-ATCGATGAAGAACGCA-GCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATT-GCAGAATTC-AGTGAATCATC-GAATC-TTTGAACGCATCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCA-TGCCTGTTTGAGTGTCA-TTAAATTCTCTC-AAA----A---CATACA-C-T--T----GA-----GTG---TGTTTTGG-A-TTGT-GGGAGTGT-CTGCTGGC----TTTGTTT----------ATACAT---------------GA-G-CCAGCTCTCCTG-AAAGAC--ATTAGC-TTT----GGGGGG--A-TGTG-C-CAAGTCACTT--C-TG------------------------------------CCTTTCTATT-------------------------GGTGT-GATAGATGAAT--AAACTTATCTA-CGCCAGG-AAAG--CA----------GGTTGCAGGT-G---AAG-CA-C-T-GT-G-----ATCTC------------------------T-CTGCTCTCT----AATTT--GA-C-A--------TTT-GTC---TGATAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
**KR919758Amanita breckoniiAmanita breckonii (Amanita breckoni...United States              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-A----A--GGGGG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGGTGGTTGT-----AGCTGG--CCCCT---T--A-GGGGC-ATGTGC-ACAC----TG----TC--TCTC--TCTC-TTGCTTG--------------TTTTTTTAAAATTCTTTCCACTT-GTGCACTG-CTTGT-AGGC-AGG-------CC--TG------G-------CATT-G--TTCA-----GG-TTGTCTATG-A-TTTTC-TTT--AC--ATAC----ACG---A---ATCA--TTGTTGTAC--AGAATG-TGAT-AATAAT----AAA-AAAAG--------------------------------AGTAATACAACTTTCAACAA-CGGA-TCTC-TTGGCTCTCGC-ATCGATGAAGAACGCA-GCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATT-GCAGAATTC-AGTGAATCATC-GAATC-TTTGAACGCATCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCA-TGCCTGTTTGAGTGTCA-TTAAATTCTCTC-AAA----A---CATACA-C-T--T----GA-----GTG---TGTTTTGG-A-TTGT-GGGAGTGT-CTGCTGGC----TTTGTTT----------ATACAT---------------GA-G-CCAGCTCTCCTG-AAAGAC--ATTAGC-TTT----GGGGGG--A-TGTG-C-CAAGTCACTT--C-TG------------------------------------CCTTTCTATT-------------------------GGTGT-GATAGATGAAT--AAACTTATCTA-CGCCAGG-AAAG--CA----------GGTTGCAGGT-G---AAG-CA-C-T-GT-G-----ATCTC------------------------T-CTGCTCTCT----AATTT--GA-C-A--------TTT-GTC---TGATAACTTG-------------------ACCTCAAATCA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
**KR919757Amanita breckoniiAmanita breckonii (Amanita breckoni...United States              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-A----A--GGGGG-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------GGGAGGTGGTTGT-----AGCTGG--CCCCT---T--A-GGGGC-ATGTGC-ACAC----TG----TC--TCTC--TCTC-TTGCTTG--------------TTTTTTTAAAATTCTTTCCACTT-GTGCACTG-CTTGT-AGGC-AGG-------CC--TG------G-------CATT-G--TTCA-----GG-TTGTCTATG-A-TTTTC-TTT--AC--ATAC----ACG---A---ATCA--TTGTTGTAC--AGAATG-TGAT-AATAAT----AAA-AAAAG--------------------------------AGTAATACAACTTTCAACAA-CGGA-TCTC-TTGGCTCTCGC-ATCGATGAAGAACGCA-GCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATT-GCAGAATTC-AGTGAATCATC-GAATC-TTTGAACGCATCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCA-TGCCTGTTTGAGTGTCA-TTAAATTCTCTC-AAA----A---CATACA-C-T--T----GA-----GTG---TGTTTTGG-A-TTGT-GGGAGTGT-CTGCTGGC----TTTGTTT----------ATACAT---------------GA-G-CCAGCTCTCCTG-AAAGAC--ATTAGC-TTT----GGGGGG--A-TGTG-C-CAAGTCACTT--C-TG------------------------------------CCTTTCTATT-------------------------GGTGT-GATAGATGAAT--AAACTTATCTA-CGCCAGG-AAAG--CA----------GGTTGCAGGT-G---AAG-CA-C-T-GT-G-----ATCTC------------------------T-CTGCTCTCT----AATTT--GA-C-A--------TTT-GTC---TGATAACT------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)