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Communication and identification of DNA based fungal species
TH003938: Amanita frostiana (Peck) Sacc. | SH179059.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH179059.07FU | New version of this SH is available: SH1553684.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 6

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales; Amanitaceae; Amanita
Index Fungorum: urn:lsid:indexfungorum.org:names:212832

Representative sequence: KP313581
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

Distribution of distances 
SH graph
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SH code (Count*/Total count**)
SH1553684.08FU (6/7);
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Distribution map
*Locations without exact coordinates are displayed as spherical country centroids
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Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
KJ638273Amanita frostianaAmanita frostiana (Amanita frostian...Canada              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGC------------GG-----------------------------------------------------------AGGATCATT-ATTGAA--------------------------------------------------------------AG-AA--A-TCT-----C-A-GGT-G----G--GGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A--GGTGGTTGT-----AGCTGG--TCCCT------A-GGGGC-ATGTGC-ACAC----TG----TC--TC----TCTC-TTGCTTG----------------TTTCTT-CATTCTCTCCACTT-GTGCACTG-CTTGT-AGGC-A-G-------CC--TGG-----A-------CACT-G--TTCA-----GG-TTGTCTATG-A-TTTTC-TTT--AC--ATAC----ATG---A---AT-AA-TTGTTGTAC--AGAATG-TGATA-----------AA-AAAAT--------------------------------AATAATACAACTTTCAACAA-CGGA-TCTC-TTGGCTCTCGC-ATCGATGAAGAACGCA-GCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATT-GCAGAATTC-AGTGAATCATC-GAATC-TTTGAACGCATCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCA-TGCCTGTTTGAGTGTCA-TTAAATTCTGTC-AAA----A---CATGCA-C-T--T----GA-----GTG---TGTTTTGG-A-TTGT-GGGAGTGT-CTGCTGGC----TTT------------TTATATAT---------------GA-G-CCAGCTCTCCTG-AAAAAC--CTTAGC-TTT----GGGGGGA---GGTG-C-CAAGTCACTT--C-TG------------------------------------CCTTTCCATT-------------------------GGTGT-GATAGATGAAT-T-AACTTATCTA-CGCCAGG--AAAG-CA----------GGCTGCAGGT-G---AAG-CA-C-T-GT-G-----ATCTCTC-------------------------TGCTCTCT----AA-TT--GA-C-A--------TTT-GTC---TGATAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
**KP313583(3)Amanita frostianaAmanita frostiana (Amanita frostian...United States              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGAA--------------------------------------------------------------AG-AA--A-TCT-----C-A-GGT-G----G--GGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A--GGTGGTTGT-----AGCTGG--TCCCT------A-GGGGC-ATGTGC-ACAC----TG----TC--TC----TCTC-TTGCTTG----------------TTTCTT-CATTCTCTCCACTT-GTGCACTG-CTTGT-AGGC-A-G-------CC--TGG-----A-------CACT-G--TTCA-----GG-TTGTCTATG-A-TTTTC-TTT--AC--ATAC----ATG---A---AT-AA-TTGTTGTAC--AGAATG-TGATA-----------AA-AAAAT--------------------------------AATAATACAACTTTCAACAA-CGGA-TCTC-TTGGCTCTCGC-ATCGATGAAGAACGCA-GCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATT-GCAGAATTC-AGTGAATCATC-GAATC-TTTGAACGCATCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCA-TGCCTGTTTGAGTGTCA-TTAAATTCTGTC-AAA----A---CATGCA-C-T--T----GA-----GTG---TGTTTTGG-A-TTGT-GGGAGTGT-CTGCTGGC----TTT------------TTATATAT---------------GA-G-CCAGCTCTCCTG-AAAAAC--CTTAGC-TTT----GGGGGGA---GGTG-C-CAAGTCACTT--C-TG------------------------------------CCTTTCCATT-------------------------GGTGT-GATAGATGAAT-T-AACTTATCTA-CGCCAGG--AAAG-CA----------GGCTGCAGGT-G---AAG-CA-C-T-GT-G-----ATCTCTC-------------------------TGCTCTCT----AA-TT--GA-C-A--------TTT-GTC---TGATAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
**KP313580Amanita frostianaAmanita frostiana (Amanita frostian...Canada              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTGAA--------------------------------------------------------------AG-AA--A-TCT-----C-A-GGT-G----G--GGGGG------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A--GGTGGTTGT-----AGCTGG--TCCCT------A-GGGGC-ATGTGC-ACAC----TGTC--TC--TC----TCTC-TTGCTTG----------------TTTCTT-CATTCTCTCCACTT-GTGCACTG-CTTGT-AGGC-A-G-------CC--TGG-----A-------CACT-G--TTCA-----GG-TTGTCTATG-A-TTTTC-TTT--AC--ATAC----ATG---A---AT-AA-TTGTTGTAC--AGAATG-TGATA-----------AA-AAAAT--------------------------------AATAATACAACTTTCAACAA-CGGA-TCTC-TTGGCTCTCGC-ATCGATGAAGAACGCA-GCGAAATGCGATAAGTAATGTGAATT-GCAGAATTC-AGTGAATCATC-GAATC-TTTGAACGCATCTTGCGCTCCTTGGTATTCCGAGGAGCA-TGCCTGTTTGAGTGTCA-TTAAATTCTGTC-AAA----A---CATGCA-C-T--T----GA-----GTG---TGTTTTGG-A-TTGT-GGGAGTGT-CTGCTGGC----TTT------------TTATATAT---------------GA-G-CCAGCTCTCCTG-AAAAAC--CTTAGC-TTT----GGGGGGA---GGTG-C-CAAGTCACTT--C-TG------------------------------------CCTTTCCATT-------------------------GGTGT-GATAGATGAAT-T-AACTTATCTA-CGCCAGG--AAAG-CA----------GGCTGCAGGT-G---AAG-CA-C-T-GT-G-----ATCTCTC-------------------------TGCTCTCT----AA-TT--GA-C-A--------TTT-GTC---TGATAA--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)