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Communication and identification of DNA based fungal species
TH003938: Amanita Pers. | SH194440.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH194440.07FU | New version of this SH is available: SH1611329.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 7

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales; Amanitaceae
Index Fungorum: urn:lsid:indexfungorum.org:names:17045

Representative sequence: JQ347048
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

Distribution of distances 
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SH210262.06FU (6/7);
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Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
**KM658286AmanitaAmanita (Amanita aff. pseudovaginat...Russian Federation              -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTG-CG------------------------------------------------------GAAGG-------ATC------------------------------------------------------------A-TT--ATT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-TC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GG-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CG-------------------CC-T-CTGG-C--T-G-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAGA---------------------------------------------------------------CA-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---ATA--TGG-TT--------ACA---CACAC-GCAT---GATGTTT----------T---------G----CATATTG----G-TTG----GC--A-T-ATTAC---------ATATGTA-TA--------------TG--------AT---AT---------ATACAAC-TTTC-AACAAC-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------TCA-C-----CTC----TCTTG----------------AGGTG---CTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTT-TGCTGG-TC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTAT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAC------------------------------------TTTG-TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GA-C-T---------GAGTGTGTCT------CTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTA-AA--------------------------------------------------------------A-TGCCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
FJ378734AmanitaAmanitaceae (uncultured Amanita)Ectomycorrhiza | sampleKobresiaChina              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-TC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GG-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CG-------------------CC-T-CTGG-C--T-G-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---ATA--TGG-TT--------ACA---CACAC-GCAT---GATGTTT----------T---------G----CATATTG----G-TTG----GC--A-T-ATTAC---------ATATGTA-TA--------------TG--------AT---AT---------ATACAAC-TTTC-AACAAC-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------TCA-C-----CTC----TCTTG----------------AGGTG---CTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTT-TGCTGG-TC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTAT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAC------------------------------------TTTG-TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GA-C-T---------GAGTGTGTCT------CTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTA-AA--------------------------------------------------------------A-TATGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
JQ347158(1)AmanitaAmanitaceae (uncultured Amanita)China              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-TC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GG-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CG-------------------CC-T-CTGG-C--T-G-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---ATA--TGG-TT--------ACA---CACAC-GCAT---GATGTTT----------T---------G----CATATTG----G-TTG----GC--A-T-ATTAC---------ATATGTA-TA--------------TG--------AT---AT---------ATACAAC-TTTC-AACAAC-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------TCA-C-----CTC----TCTTG----------------AGGTG---CTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTT-TGCTGG-TC-CG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTAT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAC------------------------------------TTTG-TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GA-C-T---------GAGTGTGTCT------CTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTA-AA--------------------------------------------------------------A-TATGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
FJ827217AmanitaAmanitaceae (uncultured Amanita)EctomycorrhizaChina              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-TC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GG-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CG-------------------CC-T-CTGG-C--T-G-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---ATA--T-G-TT--------ACA---CACAC-GCAT---GATGTTT----------T---------G----CATATTG----G-TTG----GC--A-T-ATTAC---------ATATGTA-TA--------------TG--------AT---AT---------ATACAAC-TTTC-AACAAC-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------TCA-C-----CTC----TCTTG----------------AGGTG---CTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTT-TGCTGG-TC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTAT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAC------------------------------------TTTG-TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GA-C-T---------GAGTGTGTCT------CTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTC-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTA-AA--------------------------------------------------------------A-TATGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCCC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
JQ347160AmanitaAmanitaceae (uncultured Amanita)China              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-GT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-TC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GG-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CG-------------------CC-T-CTGG-C--T-G-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---ATA--TGG-TT--------ACA---CACAC-GCAT---GATGTTT----------C---------G----CATATTG----G-TTG----GC--A-T-ATTAC---------ATATGTA-TA--------------TG--------AT---AT---------ATACAAC-TTTC-AACAAC-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------TCA-C-----CTC----TCTTG----------------AGGTG---CTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTT-TGCTGG-TC-CG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTAT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAC------------------------------------TTTG-TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GA-C-T---------GAGTGTGTCT------CTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTA----------------------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JQ347159AmanitaAmanitaceae (uncultured Amanita)China              ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AT--ATT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G---------------------------------------------------------------------------------------TG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-TC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GG-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CG--------------------C-T-CTGG-C--T-G-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------A-C--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---ATA--TGG-TT--------ACA---CACAC-GCAT---GATGTTT--------------------G----CATATTG----G-TTG----GC--A-T-ATTAC---------ATATGTA-TA--------------TG--------AT---AT---------ATACAAC-TTTC-AACAAC-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------TCA-C-----CTC----TCTTG----------------AGGTG---CTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTT-TGCTGG-TC-CG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTAT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAC------------------------------------TTTG-TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GA-C-T---------GAGTGTGTCT------CTG---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTC----------------------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** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)