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Communication and identification of DNA based fungal species
TH003938: Amanita vaginata (Bull.) Vittad. | SH194448.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH194448.07FU | New version of this SH is available: SH1611327.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 6

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales; Amanitaceae; Amanita
Index Fungorum: urn:lsid:indexfungorum.org:names:114685

Representative sequence: KX018799
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

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Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
EU819496AmanitaAmanita (Amanita cf. sinicoflava NA...sampleAngiospermaeUnited States              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GT-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--C------------------ACCT-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTT-------GT--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---AT---TGG-TTA--------CA---CACAC-ACAC---AATGTTA----------T-------------------------G-TTG----GC--------------------ATGTATA-T----------------ATT------ATTT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTTAATATATAATTAAGAAAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-CC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C--T-----------------------------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**KY580766AmanitaAmanita (Amanita sp. longicuneus)United States              --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TG-CG------------------------------------------------------GAAGG-------ATC------------------------------------------------------------A-TT--ATT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GT-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--C------------------ACCT-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTT-------GT--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---AT---TGG-TTA--------CA---CACAC-ACAC---AATGTTA----------T-------------------------G-TTG----GC--------------------ATGTATA-T----------------ATT------ATTT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTTAATATATAATTAAGAAAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-CC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C--T-----------------------------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**KX018799AmanitaAmanita (Amanita sp. longicuneus)United States              ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AGG-------ATC------------------------------------------------------------A-TT--ATT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GT-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--C------------------ACCT-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTT-------GT--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---AT---TGG-TTA--------CA---CACAC-ACAC---AATGTTA----------T-------------------------G-TTG----GC--------------------ATGTATA-T----------------ATT------ATTT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTAAATATATAATTAAGAAAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-CC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C--T-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTT-AA--------------------------------------------------------------A-TGCAC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
GU328632AmanitaBasidiomycota (uncultured Basidiomy...Soil fungal DNAUnited States              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GT-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--C------------------GCCT-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTT-------GT--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---AT---TGG-TT----------A---CACAC-ACAC---AATGTTA----------T-------------------------G-TTG----GC--------------------ATGTATA-T----------------ATT------ATTT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTTAATATATAGTTAAGAAAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-CC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C--T-----------------------------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EU819489Amanita vaginataAmanita vaginata (Amanita vaginata)sampleAngiospermaeUnited States              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GT-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--C------------------GCCT-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTT-------GT--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---AT---TGG-TC----------A---CACAC-ACAC---AATGTTA----------T-------------------------G-TTG----GC--------------------ATGTATA-T----------------ATT------ATTT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTTAATATATAATTAAGAAAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-CC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C--T-----------------------------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**KU497538Amanita vaginataAmanita vaginata (Amanita vaginata)China              ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C------------------------------------------------------------A-TT--ATT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GT-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--C------------------GCCT-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTT-------GT--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---AT---TGG-TT----------A---CACAC-ACAC---AATGTTA----------T-------------------------G-TTG----GC--------------------ATGTATA-T----------------ATT------ATTT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTTAATATAT--TTAAGAAAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-CC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTT---------------------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** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)