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Communication and identification of DNA based fungal species
TH003938: Amanita vaginata (Bull.) Vittad. | SH194459.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH194459.07FU | New version of this SH is available: SH1611369.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 2

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales; Amanitaceae; Amanita
Index Fungorum: urn:lsid:indexfungorum.org:names:114685

Representative sequence: KM658300
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

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Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
**KM658300AmanitaAmanita (Amanita aff. battarrae LE ...Russian Federation              ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G-CG------------------------------------------------------GAAGG-------ATC------------------------------------------------------------A-TT--ATT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TCCTGG---------------------------------------------------------------------------T-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GC-------------------------------------------------------------------------------NG----C-AA--------------------------------CGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA---------------------CACC-T-CTGG-C--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CG-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---AT---TGG--T---------TA---CACAC-ACGC---AATGATA----------T---------G------------------NG----GC------------------ATATATA---T----------------GTT------ATAT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C------TT----TTTTTATTTATTTAT---ATAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A---TTTG-TGCTGG-TC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---CA---------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTT-------------------------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AB015691Amanita vaginataAmanita vaginata (Amanita vaginata)Japan              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TCCTGG---------------------------------------------------------------------------T-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GC-------------------------------------------------------------------------------AG----C-AA--------------------------------CGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA---------------------CACC-T-CTGG-C--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CG-C-----------------------------AC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-AT---GT---TGG--T---------TA---CACAC-ACGC---AATGATA----------T---------G------------------TG----GC------------------ATATATATG-T----------------GTT------ATAT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTTTATTTATTTAT---ATAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-TC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---CA---------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTTT---------------------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** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)