UNITE logo

Communication and identification of DNA based fungal species
TH003938: Amanita Pers. | SH208395.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH208395.07FU | New version of this SH is available: SH1611376.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 2

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales; Amanitaceae
Index Fungorum: urn:lsid:indexfungorum.org:names:17045

Reference sequence: AB451971
Chosen by: Irja Saar
Date: 2014-11-09 22:05

Newer version(s) of this SH is/are available
SH code (Count*/Total count**)
SH1611376.08FU (2/2);
*Number of sequences carried over from pervious version
**Total number of sequences composing this SH in current version
Older version(s) of this SH is/are available
SH code (Count*/Total count**)
SH240738.06FU (2/2);
*Number of sequences carried over from previous version
**Total number of sequences composing this SH in current version
Distribution map
*Locations without exact coordinates are displayed as spherical country centroids
% 
                                                           |50                                                      |100                                                      |150                                                      |200                                                      |250                                                      |300                                                      |350                                                      |400                                                      |450                                                      |500                                                      |550                                                      |600                                                      |650                                                      |700                                                      |750                                                      |800                                                      |850                                                      |900                                                      |950                                                      |1000                                                      |1050                                                      |1100                                                      |1150                                                      |1200                                                      |1250                                                      |1300                                                      |1350                                                      |1400                                                      |1450                                                      |1500                                                      |1550                                                      |1600                                                      |1650                                                      |1700                                                      |1750                                                      |1800                                                      |1850                                                      |1900                                                      |1950                                                      |2000                                                      |2050                                                      |2100                                                      |2150                                                      |2200                                                      |2250                                                      |2300                                                      |2350                                                      |2400                                                      |2450                                                      |2500                                                      |2550                                                      |2600                                                      |2650                                                      |2700                                                      |2750                                                      |2800                                                      |2850                                                      |2900                                                      |2950                                                      |3000                                                      |3050                                                      |3100                                                      |3150                                                      |3200                                                      |3250                                                      |3300                                                      |3350                                                      |3400                                                      |3450                                                      |3500                                                      |3550                                                      |3600                                                      |3650                                                      |3700                                                      |3750                                                      |3800                                                      |3850                                                      |3900                                                      |3950                                                      |4000                                                      |4050                                                      |4100                                                      |4150                                                      |4200                                                      |4250                                                      |4300                                                      |4350                                                      |4400                                                      |4450                                                      |4500                                                      |4550                                                      |4600                                                      |4650                                                      |4700                                                      |4750                                                      |4800                                                      |4850                                                      |4900                                                      |4950                                                      |5000                                                      |5050                                                      |5100                                                      |5150                                                      |5200                                                      |5250                                                      |5300                                                      |5350                                                      |5400                                                      |5450                                                      |5500                                                      |5550                                                      |5600                                                      |5650                                                      |5700                                                      |5750                                                      |5800                                                      |5850                                                      |5900                                                      |5950                                                      |6000
Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
AB451971(1)AmanitaAmanita vaginata (Amanita vaginata)sampleDipterocarpaceaeThailand              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-CG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-CACTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C----T--------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-------GG-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CA-------------------CC-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C---------------------------ACTC-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-ATA--ATG--TT-------------TA---CACAC-ACAT---GTAATAC------AAGAT-----------------ATTG----G-A------GT--A-T-AT---------------------------------------------------ATAATAA---AGTACAAC-TTTC-AACAAC-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCA-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCG-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C------TT----TTCT---------------TTGGGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGCAA----CTT-TGCTGG-TCTTG--------TCTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AA-------------------------------------TTTG-TTTA---------------------------------------------------------------------------CGCT-GA-C-T-------C-GAGTGTCTCGG-----CTT---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTCC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------T-T----------------------------------------------------TTC-AA-----------------------------------------------------------------ATGC----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CCC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)