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Communication and identification of DNA based fungal species
TH003938: Amanita Pers. | SH526549.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH526549.07FU | New version of this SH is available: SH1611366.08FU

Distance to the closest SH: 1.5
No. of sequences in SH: 2

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetidae; Agaricales; Amanitaceae
Index Fungorum: urn:lsid:indexfungorum.org:names:17045

Representative sequence: KM658301
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

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Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
**KM658301AmanitaAmanita (Amanita aff. vaginata LE 2...Russian Federation              -------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTG-CG------------------------------------------------------GAAGG-------ATC------------------------------------------------------------A-TT--ATT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GT-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CG--CA------------TGCTT-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AG-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-ATA--AT---TGG-TTA--------CA---CACAC-ACAC---AATGTTA----------T-------------------------G-TTG----GC------------------ATATATATA-T----------------ATT------AATT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-NTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTTCAAGT-------AAGAAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-TC-TG--------TGTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C--T-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TTT-AA--------------------------------------------------------------A-TGCAA----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
**KT779078AmanitaAmanita (Amanita sp. SFC20140730-10...              -----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAA-TG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AAA-C-TTCTGG---------------------------------------------------------------------------C-T------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------G------------------------------------------------------------------------------------------G-AT-G-C-----T-G--------------------------------------------------------------------------------------TTG-----TGCT--------------------------------------------------------GG-CC-----C---TT--------------------------------------------------------------------------------------------------------------T--------GT-------------------------------------------------------------------------------GG----C-AA--------------------------------TGT----G--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA--CG--CA------------TGCTT-T-CTGG-T--C-A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT---------T--G----------------------------------T----TT-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C-TTCT-G---------------------------------T-TCC------------------------------------------------------ACC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TGTG-C-ACTGA---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CTGTAG-----------------------------------------------------------------A-CA-C-----------------------------AG-T-GT-----GTCT----------A-T----------G-ATA--AT---TGG-TTA--------CA---CACAC-ACAC---AATGTTA----------T-------------------------G-TTG----GC--A--------------TATATATATA-T----------------ATT------AATT-ATAT-----AAATACAAC-TTTC-AACAAT-GG-ATCTCTTGGC-TCTC-GCATCGA------TGAAG-AACA-CAGC-GAAATG-TGATAAGTAATG-TGAATTGCAGA-A-TCCAGTGAATCATCGAATC--------TTTGAA--CGCA-TCTTGCGCTCCTTGGC-ATTCCG-AGGAGCATGC------------------------------------------------CTG-TTTGAGTGTCA-TTA-AAC--TATC-AAA------ACA-C-----TTT----TTTTCAAGT-------AAGAAAAGTG---TTTTGG-AC-TTTGGGAGT-A----TTG-TGCTGG-TC-TG--------TTTGAG--------------------------------CCAGC-TCTCCTC--------AAA------A--G---C----------------A-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT----AGCTTT------------------------------------------------G--G--------AGA--C-----CAT-C-AG--TG-TGA-------------------T-AAT------------------------------------TTG--TTTA---------------------------------------------------------------------------CACT-GG-C-T-------T-----------------CTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------C--T------------------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** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)