UNITE logo

Communication and identification of DNA based fungal species
TH002803: Russula Pers. | SH032584.07FU | DOI: 10.15156/BIO/SH032584.07FU | New version of this SH is available: SH1226619.08FU

Distance to the closest SH: 3.0
No. of sequences in SH: 2

Placement in the fungal classification
Fungi; Dikarya; Basidiomycota; Agaricomycotina; Agaricomycetes; Agaricomycetes sbc Incertae sedis; Russulales; Russulaceae
Index Fungorum: urn:lsid:indexfungorum.org:names:18493

Representative sequence: JN168741
Chosen by: automatically by the program
Date: 2013-11-19

Newer version(s) of this SH is/are available
SH code (Count*/Total count**)
SH1226619.08FU (2/3);
*Number of sequences carried over from pervious version
**Total number of sequences composing this SH in current version
Older version(s) of this SH is/are available
SH code (Count*/Total count**)
SH035231.06FU (1/2);
*Number of sequences carried over from previous version
**Total number of sequences composing this SH in current version
Distribution map
*Locations without exact coordinates are displayed as spherical country centroids
% 
                                                           |50                                                      |100                                                      |150                                                      |200                                                      |250                                                      |300                                                      |350                                                      |400                                                      |450                                                      |500                                                      |550                                                      |600                                                      |650                                                      |700                                                      |750                                                      |800                                                      |850                                                      |900                                                      |950                                                      |1000                                                      |1050                                                      |1100                                                      |1150                                                      |1200                                                      |1250                                                      |1300                                                      |1350                                                      |1400                                                      |1450                                                      |1500                                                      |1550                                                      |1600                                                      |1650                                                      |1700                                                      |1750                                                      |1800                                                      |1850                                                      |1900                                                      |1950                                                      |2000                                                      |2050                                                      |2100                                                      |2150                                                      |2200                                                      |2250                                                      |2300                                                      |2350                                                      |2400                                                      |2450                                                      |2500                                                      |2550                                                      |2600                                                      |2650                                                      |2700                                                      |2750                                                      |2800                                                      |2850                                                      |2900                                                      |2950                                                      |3000                                                      |3050                                                      |3100                                                      |3150                                                      |3200                                                      |3250
Accession numberUNITE taxon nameINSD taxon nameSequence sourceInteracting taxaSampling area<.50.51.01.52.02.53.0  Alignment  
JN168741RussulaRussulaceae (uncultured Russula)Dicymbe corymbosaGuyana              ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA---TTATAG-TATAAC---------TG-AGATTGC--------T-----A-GGGCT-G-TC-------G-CTG--ACCTTTTGAAA--GAAAAGGTTG-------TGCACGC-CCAAGT------GC---TC-T----CTC-GC-A-----------------T----CCCATATTT--TC-ACCC-------------------------------------C-TTTGTGCAT-CA-CCGCGT---G--GG--------CT---ACC------CTTTTTGACTTGTTCAGAAG----GGGG-CG-----TTCG-C-G-----T--TTTT------ACAACACA----CC---CCCTT--------------TT-TAATGC--------ATGT-A-TA-GAA-T-G-T-C-TTG------------------CTTTTTGC-GATCACA-CGCAAT-A-AAT----ACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATG-AAGAACGCAG-C-GAAATGCGATACGTAATGT-GAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCA-CC--TTGCG-CCCCTTGGT-ATTCCGAGGGGCACACCTG-TTTGA-GTGTC-GTGAAACA-CCAT-C--AACCCTCTT--GG-TTTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAC-T-------G-GG--AAGGA-TTGGA-C-TTTGGAG---------------------------GTTTTTAC--------CTTGCT-GGTCT-----CTTTT------------GAAG--CC-AGCTCCT-CCTAAA-TG-AATTA-----------------------------------GT-G--G--GATC-TGCT-TT-GC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAACCC-TTG-A---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGTG-A-T-AAG--TA-TGC-TTC---TATGTCTT--------GGGTTTT-GC-AC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TG-----------------------------------------------------------------T-----------------------------------------------------------------------TGC-----------------CT----CAGAA-ACCT--GC----------------------------------------------------------TTCC--AA----CTGT---C-TT----TG--AA--------------------T---AAAGA---C--AATG------------------------------------------------------------------------------TTCAAGT-TGT-----------G----AC-TT--GAC-----CT-------------------------------------TAGAAAC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
**KT290006RussulaFungi (uncultured fungus)Guyana              ---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CA---TTATAG-TATAAC---------TG-AGATTGC--------T-----A-GGGCT-G-TC-------G-CTG--ACCTTTTGAAA--GAAAAGGTTG-------TGCACGC-CCAAGT------GC---TC-T----CTC-GC-A-----------------T----CCCATATTT--TC-ACCC-------------------------------------C-TTTGTGCAT-CA-CCGCGT---G--GG--------CT---ACC------CTTTTTGACTTGTTCAGAAG----GGGG-CG-----TTCG-C-G-----T--TTTT------ACAACACA----CC---CCCTT--------------TT-TAATGC--------ATGT-A-TA-GAA-T-G-T-C-TTG------------------CTTTTTGC-GATCACA-CGCAAT-A-AAT----ACAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGCTCTCGCATCGATG-AAGAACGCAG-C-GAAATGCGATACGTAATGT-GAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCA-CC--TTGCG-CCCCTTGGT-ATTCCGAGGGGCACACCTG-TTTGA-GTGTC-GTGAAACA-CCAT-C--AACCCTCTT--GG-TTTC---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TT-GAC-T-------G-GG--AAGGA-TTGGA-C-TTTGGAG---------------------------GTTTTTAC--------CTTGCT-GGTCT-----CTTTT------------GAAG--CC-AGCTCCT-CCTAAA-TG-AATTA-----------------------------------GT-G--G--GATC-TGCT-TT-GC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TAACCC-TTG-A---------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------CGTG-A-T-AAG--TA-TGC-TTC---TATGTCTT--------GGGTTTT-GC-AC-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------TG-----------------------------------------------------------------T-----------------------------------------------------------------------TGC-----------------CT----CAGAA-ACCT--GC----------------------------------------------------------TTCC--AA----CTGT---C-TT----TG--AA--------------------T---AAAGA---C--AATG------------------------------------------------------------------------------TTCAAGT-TGT-----------G----AC-TT--GAC-----CT-------------------------------------TAGAAAC--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
** - sequence was added after initial calculation of SH-s; (x) - there are x duplicates for this sequence; - click to see the extended view of this SH (all sequences listed)